Số/Ký hiệu 4805/VPCP-ĐMDN Ngày ban hành 11/05/2017 Phương án sắp xếp Viện Nghiên cứu Bông và Phát triển Nông nghiệp Nha Hố
Số/Ký hiệu 88/QĐ-BNN-TCCB Ngày ban hành 16/01/2012 Thành lập Viện Nghiên cứu Mía Đường trực thuộc Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam
Số/Ký hiệu 2051/QĐ-BNN-TCCB Ngày ban hành 29/07/2010 Thành lập Trung tâm Chuyển giao công nghệ và Khuyến nông trực thuộc Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam trên cơ sở chuyển giao nguyên trạng và tổ chức lại Trung tâm Chuyển giao công nghệ và Khuyến nông trực thuộc Viện Cây lương thực và Cây thực phẩm
Số/Ký hiệu 1687/QĐ-BNN-TCCB Ngày ban hành 21/06/2010 Thành lập Trung tâm Nghiên cứu Dâu tằm tơ Trung ương trực thuộc Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam trên cơ sở chuyển giao nguyên trạng và tổ chức lại Trung tâm Nghiên cứu Dâu tằm tơ trực thuộc Viện Nghiên cứu Rau quả
Số/Ký hiệu 3533/QĐ-BNN-TCCB Ngày ban hành 10/12/2009 Chuyển Viện Lúa Đồng bằng sông Cửu Long trực thuộc Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn về trực thuộc Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam
Số/Ký hiệu 3530/QĐ-BNN-TCCB Ngày ban hành 10/12/2009 Chuyển Viện Nghiên cứu cây ăn quả Miền Nam trực thuộc Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn về trực thuộc Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam
Số/Ký hiệu 3531/QĐ-BNN-TCCB Ngày ban hành 10/12/2009 Chuyển Viện Khoa học kỹ thuật Nông nghiệp Miền Nam trực thuộc Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn về trực thuộc Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam
Số/Ký hiệu 72/2008/QĐ-BNN Ngày ban hành 10/06/2008 Chuyển Viện Khoa học kỹ thuật nông lâm nghiệp Tây Nguyên từ trực thuộc Bộ sang trực thuộc Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam
Số/Ký hiệu 1084/QĐ-BNN-TCCB Ngày ban hành 10/04/2008 Thành lập Viện Môi trường nông nghiệp trực thuộc Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam